HMDCM

library(hmcdm)

Load the spatial rotation data

N = length(Test_versions)
J = nrow(Q_matrix)
K = ncol(Q_matrix)
L = nrow(Test_order)
Jt = J/L

(1) Simulate responses based on the HMDCM model

Q_examinee <- Q_list(Q_matrix, Test_order, Test_versions)
class_0 <- sample(1:2^K, N, replace = L)
Alphas_0 <- matrix(0,N,K)
thetas_true = rnorm(N)
for(i in 1:N){
  Alphas_0[i,] <- inv_bijectionvector(K,(class_0[i]-1))
}
lambdas_true = c(-1, 1.8, .277, .055)
Alphas <- simulate_alphas_HO_sep(lambdas_true,thetas_true,Alphas_0,Q_examinee,L,Jt)
table(rowSums(Alphas[,,5]) - rowSums(Alphas[,,1])) # used to see how much transition has taken place
#> 
#>   0   1   2   3   4 
#>  52 104 118  66  10
itempars_true <- array(runif(Jt*2*L,.1,.2), dim = c(Jt,2,L))
ETAs <- ETAmat(K, J, Q_matrix)
Y_sim <- simDINA(Alphas,itempars_true,ETAs,Test_order,Test_versions)

(2) Run the MCMC to sample parameters from the posterior distribution

output_HMDCM = hmcdm(Y_sim,Q_matrix,"DINA_HO",Test_order,Test_versions,
                     chain_length=100,burn_in=30,
                     theta_propose = 2,deltas_propose = c(.45,.35,.25,.06))
#> 0

output_HMDCM
#> 
#> Model: DINA_HO 
#> 
#> Sample Size: 350
#> Number of Items: 50
#> Number of Time Points: 5 
#> 
#> Chain Length: 100, burn-in: 30

summary(output_HMDCM)
#> 
#> Model: DINA_HO 
#> 
#> Item Parameters:
#>  ss_EAP  gs_EAP
#>  0.1894 0.15206
#>  0.1480 0.09312
#>  0.1152 0.08765
#>  0.1659 0.06153
#>  0.1984 0.22248
#>    ... 45 more items
#> 
#> Transition Parameters:
#>    lambdas_EAP
#> λ0    -0.91038
#> λ1     1.67369
#> λ2     0.20339
#> λ3     0.05953
#> 
#> Class Probabilities:
#>      pis_EAP
#> 0000 0.06275
#> 0001 0.07008
#> 0010 0.08302
#> 0011 0.05009
#> 0100 0.04436
#>    ... 11 more classes
#> 
#> Deviance Information Criterion (DIC): 18842.23 
#> 
#> Posterior Predictive P-value (PPP):
#> M1: 0.5171
#> M2:  0.49
#> total scores:  0.6281
a <- summary(output_HMDCM)
a$ss_EAP
#>             [,1]
#>  [1,] 0.18943138
#>  [2,] 0.14800448
#>  [3,] 0.11524231
#>  [4,] 0.16592217
#>  [5,] 0.19841856
#>  [6,] 0.21358473
#>  [7,] 0.13086322
#>  [8,] 0.11382165
#>  [9,] 0.15116517
#> [10,] 0.08334316
#> [11,] 0.10767596
#> [12,] 0.15241457
#> [13,] 0.16952530
#> [14,] 0.17308469
#> [15,] 0.13206102
#> [16,] 0.12905850
#> [17,] 0.18782819
#> [18,] 0.15624478
#> [19,] 0.19423825
#> [20,] 0.11354687
#> [21,] 0.15503642
#> [22,] 0.16873043
#> [23,] 0.11151350
#> [24,] 0.16755891
#> [25,] 0.18808368
#> [26,] 0.16173682
#> [27,] 0.16390665
#> [28,] 0.22115375
#> [29,] 0.17303699
#> [30,] 0.23461946
#> [31,] 0.12247444
#> [32,] 0.21377783
#> [33,] 0.19877232
#> [34,] 0.12028280
#> [35,] 0.10389110
#> [36,] 0.14888594
#> [37,] 0.14467656
#> [38,] 0.12874438
#> [39,] 0.17898101
#> [40,] 0.17719336
#> [41,] 0.12893170
#> [42,] 0.13437178
#> [43,] 0.16618123
#> [44,] 0.11959291
#> [45,] 0.17049344
#> [46,] 0.16641688
#> [47,] 0.18550216
#> [48,] 0.12596618
#> [49,] 0.12267173
#> [50,] 0.11334908
a$lambdas_EAP
#>           [,1]
#> λ0 -0.91038078
#> λ1  1.67369353
#> λ2  0.20338832
#> λ3  0.05953326
a$PPP_total_scores
#>              [,1]       [,2]       [,3]       [,4]       [,5]
#>   [1,] 0.28571429 0.68571429 0.88571429 0.70000000 0.81428571
#>   [2,] 0.98571429 0.24285714 0.47142857 0.70000000 0.41428571
#>   [3,] 0.35714286 0.72857143 0.97142857 0.58571429 0.44285714
#>   [4,] 0.67142857 0.65714286 0.28571429 0.24285714 1.00000000
#>   [5,] 0.90000000 0.45714286 0.51428571 0.81428571 0.47142857
#>   [6,] 0.60000000 0.34285714 0.77142857 0.12857143 0.45714286
#>   [7,] 0.50000000 0.44285714 0.11428571 0.07142857 1.00000000
#>   [8,] 0.54285714 0.50000000 0.81428571 0.85714286 0.80000000
#>   [9,] 0.48571429 0.85714286 1.00000000 0.72857143 0.77142857
#>  [10,] 0.84285714 1.00000000 0.67142857 1.00000000 1.00000000
#>  [11,] 0.98571429 0.57142857 0.88571429 0.98571429 0.90000000
#>  [12,] 0.35714286 0.77142857 0.81428571 0.78571429 1.00000000
#>  [13,] 0.95714286 0.04285714 0.34285714 0.38571429 0.31428571
#>  [14,] 0.40000000 1.00000000 0.81428571 0.81428571 0.35714286
#>  [15,] 0.51428571 0.54285714 0.52857143 0.48571429 0.78571429
#>  [16,] 0.65714286 0.52857143 0.48571429 1.00000000 0.42857143
#>  [17,] 0.88571429 0.60000000 0.48571429 0.05714286 0.18571429
#>  [18,] 0.84285714 0.90000000 1.00000000 0.41428571 0.77142857
#>  [19,] 0.61428571 0.82857143 0.54285714 0.70000000 0.82857143
#>  [20,] 0.55714286 0.35714286 0.54285714 1.00000000 0.80000000
#>  [21,] 0.48571429 0.27142857 0.45714286 0.81428571 0.84285714
#>  [22,] 0.45714286 1.00000000 0.82857143 1.00000000 0.82857143
#>  [23,] 0.78571429 0.54285714 0.91428571 0.95714286 0.70000000
#>  [24,] 0.77142857 0.77142857 0.81428571 1.00000000 1.00000000
#>  [25,] 0.80000000 0.88571429 0.47142857 0.78571429 0.75714286
#>  [26,] 0.81428571 0.80000000 0.84285714 0.54285714 0.10000000
#>  [27,] 0.50000000 0.88571429 0.57142857 1.00000000 0.44285714
#>  [28,] 0.82857143 1.00000000 0.71428571 1.00000000 0.81428571
#>  [29,] 0.90000000 0.95714286 0.90000000 0.77142857 0.80000000
#>  [30,] 0.58571429 0.92857143 0.85714286 1.00000000 0.52857143
#>  [31,] 0.44285714 0.50000000 1.00000000 0.55714286 1.00000000
#>  [32,] 0.54285714 0.32857143 0.22857143 0.60000000 0.01428571
#>  [33,] 0.61428571 0.71428571 0.92857143 0.87142857 0.62857143
#>  [34,] 0.91428571 0.67142857 0.98571429 0.97142857 0.64285714
#>  [35,] 0.47142857 0.54285714 0.24285714 1.00000000 0.24285714
#>  [36,] 0.75714286 0.57142857 0.38571429 0.30000000 0.78571429
#>  [37,] 0.77142857 0.78571429 0.12857143 0.85714286 0.57142857
#>  [38,] 0.64285714 1.00000000 0.28571429 0.88571429 0.57142857
#>  [39,] 0.77142857 0.20000000 0.82857143 0.82857143 0.70000000
#>  [40,] 1.00000000 0.47142857 0.75714286 0.75714286 0.85714286
#>  [41,] 0.24285714 0.11428571 0.94285714 0.61428571 0.28571429
#>  [42,] 0.64285714 0.51428571 0.51428571 0.81428571 0.04285714
#>  [43,] 0.82857143 0.71428571 0.81428571 0.65714286 0.88571429
#>  [44,] 0.68571429 0.90000000 0.28571429 0.45714286 0.74285714
#>  [45,] 0.98571429 0.34285714 0.90000000 0.32857143 0.77142857
#>  [46,] 0.92857143 0.54285714 0.97142857 0.21428571 0.85714286
#>  [47,] 0.72857143 0.75714286 1.00000000 0.84285714 0.84285714
#>  [48,] 0.50000000 0.75714286 0.51428571 0.77142857 0.78571429
#>  [49,] 0.91428571 0.54285714 1.00000000 0.85714286 0.80000000
#>  [50,] 0.65714286 0.85714286 0.74285714 0.72857143 0.31428571
#>  [51,] 0.74285714 0.50000000 0.75714286 0.70000000 1.00000000
#>  [52,] 0.58571429 0.81428571 0.38571429 0.48571429 0.80000000
#>  [53,] 0.45714286 0.40000000 0.44285714 0.47142857 0.04285714
#>  [54,] 0.71428571 0.71428571 0.48571429 0.80000000 0.84285714
#>  [55,] 0.61428571 0.87142857 0.88571429 1.00000000 0.41428571
#>  [56,] 0.64285714 0.55714286 0.82857143 0.78571429 0.68571429
#>  [57,] 0.82857143 0.35714286 1.00000000 1.00000000 0.48571429
#>  [58,] 0.92857143 0.45714286 0.47142857 0.11428571 0.22857143
#>  [59,] 0.47142857 0.81428571 0.60000000 0.32857143 0.87142857
#>  [60,] 0.25714286 0.88571429 0.01428571 0.74285714 0.75714286
#>  [61,] 0.47142857 0.15714286 0.87142857 0.10000000 0.92857143
#>  [62,] 0.62857143 0.34285714 0.58571429 0.22857143 0.81428571
#>  [63,] 0.32857143 0.52857143 0.80000000 0.12857143 0.45714286
#>  [64,] 0.34285714 0.48571429 0.82857143 0.74285714 0.80000000
#>  [65,] 0.87142857 0.84285714 0.77142857 0.78571429 1.00000000
#>  [66,] 0.34285714 0.64285714 0.38571429 0.88571429 0.80000000
#>  [67,] 0.65714286 0.71428571 0.75714286 1.00000000 1.00000000
#>  [68,] 0.87142857 0.54285714 1.00000000 1.00000000 0.70000000
#>  [69,] 1.00000000 0.05714286 0.84285714 0.21428571 0.31428571
#>  [70,] 0.31428571 0.61428571 0.74285714 0.22857143 0.34285714
#>  [71,] 0.24285714 0.77142857 0.94285714 1.00000000 1.00000000
#>  [72,] 0.84285714 1.00000000 0.22857143 1.00000000 0.75714286
#>  [73,] 0.72857143 0.30000000 0.22857143 0.78571429 1.00000000
#>  [74,] 0.48571429 0.51428571 1.00000000 0.44285714 0.87142857
#>  [75,] 0.54285714 0.27142857 0.74285714 0.92857143 0.78571429
#>  [76,] 0.60000000 0.75714286 0.95714286 0.25714286 0.80000000
#>  [77,] 0.44285714 0.77142857 0.62857143 0.38571429 0.44285714
#>  [78,] 0.27142857 0.81428571 0.71428571 0.50000000 0.85714286
#>  [79,] 0.52857143 0.20000000 0.61428571 0.55714286 0.88571429
#>  [80,] 0.47142857 1.00000000 0.75714286 0.72857143 0.40000000
#>  [81,] 0.75714286 0.71428571 1.00000000 0.41428571 0.84285714
#>  [82,] 0.62857143 0.25714286 0.64285714 0.94285714 0.55714286
#>  [83,] 0.72857143 1.00000000 0.87142857 0.54285714 0.84285714
#>  [84,] 0.65714286 0.92857143 0.91428571 0.75714286 0.94285714
#>  [85,] 0.50000000 0.54285714 0.40000000 0.38571429 0.70000000
#>  [86,] 0.71428571 0.44285714 0.21428571 1.00000000 1.00000000
#>  [87,] 0.54285714 0.64285714 0.91428571 0.31428571 0.88571429
#>  [88,] 0.98571429 0.64285714 0.27142857 0.51428571 0.48571429
#>  [89,] 0.85714286 0.37142857 0.50000000 0.14285714 0.28571429
#>  [90,] 0.11428571 0.12857143 0.77142857 0.31428571 0.72857143
#>  [91,] 0.97142857 0.61428571 0.88571429 0.90000000 0.82857143
#>  [92,] 0.81428571 0.82857143 0.55714286 1.00000000 0.87142857
#>  [93,] 0.72857143 0.48571429 0.52857143 0.34285714 0.85714286
#>  [94,] 0.38571429 0.80000000 0.50000000 1.00000000 0.10000000
#>  [95,] 0.88571429 0.58571429 0.60000000 0.57142857 0.54285714
#>  [96,] 1.00000000 0.50000000 0.41428571 0.15714286 0.81428571
#>  [97,] 0.91428571 0.21428571 0.74285714 0.04285714 0.87142857
#>  [98,] 0.28571429 0.10000000 0.80000000 0.82857143 0.48571429
#>  [99,] 0.85714286 0.85714286 0.78571429 0.12857143 0.20000000
#> [100,] 0.87142857 0.42857143 0.61428571 1.00000000 0.01428571
#> [101,] 0.38571429 0.77142857 0.81428571 1.00000000 1.00000000
#> [102,] 0.27142857 0.61428571 0.80000000 0.81428571 0.22857143
#> [103,] 0.82857143 0.87142857 0.11428571 0.42857143 0.78571429
#> [104,] 0.98571429 0.95714286 0.67142857 0.61428571 0.01428571
#> [105,] 0.62857143 0.77142857 1.00000000 0.48571429 0.14285714
#> [106,] 0.68571429 0.94285714 1.00000000 0.90000000 0.87142857
#> [107,] 0.54285714 0.47142857 0.20000000 0.10000000 1.00000000
#> [108,] 0.41428571 0.62857143 0.42857143 0.20000000 1.00000000
#> [109,] 0.84285714 0.62857143 0.12857143 0.40000000 0.80000000
#> [110,] 0.71428571 0.68571429 0.94285714 0.37142857 0.68571429
#> [111,] 0.90000000 0.47142857 0.50000000 0.40000000 0.60000000
#> [112,] 0.85714286 0.51428571 0.10000000 0.82857143 0.24285714
#> [113,] 0.64285714 0.45714286 0.82857143 0.40000000 0.75714286
#> [114,] 0.87142857 0.45714286 0.80000000 0.74285714 0.44285714
#> [115,] 0.60000000 0.54285714 0.84285714 0.44285714 0.91428571
#> [116,] 0.87142857 0.97142857 0.12857143 0.14285714 0.90000000
#> [117,] 0.52857143 0.48571429 0.54285714 1.00000000 0.04285714
#> [118,] 0.80000000 0.22857143 0.40000000 0.70000000 0.97142857
#> [119,] 0.52857143 0.81428571 0.65714286 0.61428571 0.47142857
#> [120,] 0.54285714 1.00000000 0.82857143 0.38571429 1.00000000
#> [121,] 0.12857143 0.78571429 0.54285714 0.08571429 0.35714286
#> [122,] 0.62857143 0.61428571 0.37142857 0.48571429 0.87142857
#> [123,] 0.61428571 0.45714286 0.91428571 0.74285714 0.88571429
#> [124,] 0.41428571 1.00000000 0.77142857 0.01428571 1.00000000
#> [125,] 0.72857143 0.61428571 1.00000000 0.95714286 0.37142857
#> [126,] 0.48571429 0.82857143 0.85714286 0.48571429 1.00000000
#> [127,] 0.72857143 0.38571429 0.34285714 0.94285714 0.55714286
#> [128,] 0.77142857 0.30000000 0.80000000 0.48571429 0.77142857
#> [129,] 0.78571429 0.28571429 0.90000000 0.78571429 0.57142857
#> [130,] 0.18571429 0.90000000 0.74285714 0.78571429 1.00000000
#> [131,] 0.20000000 0.95714286 0.94285714 0.61428571 1.00000000
#> [132,] 0.30000000 0.17142857 0.44285714 0.80000000 0.38571429
#> [133,] 0.37142857 0.67142857 0.75714286 0.45714286 1.00000000
#> [134,] 0.44285714 0.48571429 0.85714286 0.70000000 0.14285714
#> [135,] 0.44285714 0.44285714 0.20000000 0.15714286 0.72857143
#> [136,] 0.24285714 0.84285714 0.97142857 0.44285714 0.68571429
#> [137,] 0.37142857 0.48571429 0.50000000 0.27142857 1.00000000
#> [138,] 0.51428571 0.45714286 0.72857143 0.58571429 0.72857143
#> [139,] 0.71428571 0.75714286 0.51428571 0.74285714 0.41428571
#> [140,] 0.67142857 0.54285714 0.82857143 0.80000000 0.45714286
#> [141,] 0.52857143 0.91428571 0.30000000 0.45714286 0.45714286
#> [142,] 0.24285714 0.10000000 0.24285714 0.68571429 0.95714286
#> [143,] 0.37142857 0.02857143 0.07142857 0.60000000 0.25714286
#> [144,] 0.87142857 1.00000000 0.85714286 1.00000000 0.78571429
#> [145,] 0.34285714 0.88571429 0.84285714 0.88571429 0.41428571
#> [146,] 0.74285714 0.67142857 0.44285714 0.85714286 1.00000000
#> [147,] 0.40000000 0.31428571 0.41428571 0.24285714 0.10000000
#> [148,] 0.94285714 0.41428571 0.82857143 1.00000000 0.34285714
#> [149,] 0.31428571 0.31428571 0.12857143 0.18571429 0.41428571
#> [150,] 0.35714286 0.78571429 0.45714286 0.00000000 1.00000000
#> [151,] 0.27142857 0.71428571 0.54285714 0.27142857 0.81428571
#> [152,] 0.58571429 1.00000000 1.00000000 0.82857143 0.80000000
#> [153,] 0.50000000 0.67142857 0.72857143 0.12857143 0.75714286
#> [154,] 0.68571429 0.50000000 0.65714286 0.42857143 0.35714286
#> [155,] 0.74285714 0.54285714 0.44285714 0.48571429 0.72857143
#> [156,] 0.15714286 0.54285714 0.67142857 0.14285714 0.32857143
#> [157,] 0.15714286 0.87142857 0.25714286 0.80000000 0.57142857
#> [158,] 0.42857143 0.57142857 0.82857143 1.00000000 0.80000000
#> [159,] 0.42857143 0.17142857 0.38571429 0.88571429 0.25714286
#> [160,] 0.22857143 0.41428571 0.60000000 0.20000000 0.74285714
#> [161,] 0.34285714 0.67142857 0.62857143 0.10000000 0.70000000
#> [162,] 0.52857143 0.45714286 0.60000000 0.48571429 0.15714286
#> [163,] 0.65714286 0.82857143 0.71428571 0.97142857 0.61428571
#> [164,] 0.67142857 0.84285714 0.47142857 0.01428571 0.85714286
#> [165,] 0.75714286 0.68571429 0.47142857 0.40000000 1.00000000
#> [166,] 0.50000000 0.42857143 0.45714286 0.27142857 1.00000000
#> [167,] 0.70000000 0.38571429 0.62857143 0.05714286 0.47142857
#> [168,] 0.35714286 0.44285714 0.67142857 0.92857143 0.68571429
#> [169,] 0.72857143 0.75714286 0.64285714 0.81428571 0.78571429
#> [170,] 0.60000000 0.15714286 0.40000000 1.00000000 0.84285714
#> [171,] 0.45714286 0.70000000 0.44285714 0.85714286 0.32857143
#> [172,] 0.88571429 0.94285714 1.00000000 0.70000000 1.00000000
#> [173,] 0.52857143 1.00000000 0.10000000 0.84285714 0.84285714
#> [174,] 0.80000000 0.12857143 0.41428571 0.30000000 1.00000000
#> [175,] 0.60000000 0.25714286 0.28571429 0.72857143 0.38571429
#> [176,] 0.84285714 0.22857143 0.48571429 1.00000000 1.00000000
#> [177,] 0.80000000 0.10000000 0.71428571 1.00000000 0.42857143
#> [178,] 0.38571429 0.98571429 0.17142857 0.64285714 0.61428571
#> [179,] 0.58571429 0.65714286 0.15714286 0.77142857 1.00000000
#> [180,] 0.24285714 0.74285714 0.74285714 0.88571429 0.85714286
#> [181,] 0.78571429 0.87142857 0.38571429 0.67142857 0.07142857
#> [182,] 0.45714286 0.44285714 0.78571429 1.00000000 0.47142857
#> [183,] 0.91428571 0.45714286 1.00000000 0.50000000 1.00000000
#> [184,] 0.91428571 0.08571429 0.92857143 0.62857143 0.98571429
#> [185,] 0.82857143 0.90000000 0.85714286 0.41428571 0.41428571
#> [186,] 0.37142857 0.34285714 0.30000000 0.80000000 0.87142857
#> [187,] 0.42857143 0.50000000 0.82857143 0.98571429 0.71428571
#> [188,] 0.58571429 0.70000000 0.48571429 0.77142857 0.74285714
#> [189,] 0.91428571 0.21428571 0.80000000 0.44285714 1.00000000
#> [190,] 0.41428571 0.77142857 0.08571429 1.00000000 0.85714286
#> [191,] 0.87142857 0.21428571 0.34285714 0.80000000 0.40000000
#> [192,] 0.75714286 0.44285714 0.64285714 0.31428571 0.28571429
#> [193,] 0.70000000 0.70000000 1.00000000 0.05714286 0.82857143
#> [194,] 0.92857143 0.02857143 0.85714286 0.85714286 0.50000000
#> [195,] 0.52857143 0.24285714 0.24285714 1.00000000 0.85714286
#> [196,] 0.20000000 0.91428571 0.72857143 0.14285714 0.85714286
#> [197,] 0.88571429 0.02857143 0.45714286 0.84285714 0.45714286
#> [198,] 0.87142857 0.52857143 0.14285714 0.81428571 0.40000000
#> [199,] 0.45714286 0.24285714 0.77142857 0.40000000 1.00000000
#> [200,] 0.50000000 0.67142857 0.28571429 0.67142857 0.65714286
#> [201,] 0.38571429 0.80000000 1.00000000 0.38571429 0.04285714
#> [202,] 0.91428571 1.00000000 0.62857143 0.70000000 0.92857143
#> [203,] 0.87142857 0.88571429 0.27142857 0.35714286 0.62857143
#> [204,] 0.52857143 0.77142857 0.77142857 1.00000000 0.45714286
#> [205,] 0.72857143 0.78571429 0.75714286 0.82857143 0.82857143
#> [206,] 0.81428571 0.47142857 0.75714286 0.75714286 0.20000000
#> [207,] 0.84285714 0.77142857 0.34285714 0.77142857 0.91428571
#> [208,] 0.22857143 0.14285714 0.87142857 0.20000000 0.34285714
#> [209,] 0.84285714 0.52857143 0.35714286 1.00000000 0.81428571
#> [210,] 0.12857143 0.51428571 0.38571429 0.47142857 1.00000000
#> [211,] 0.74285714 0.91428571 1.00000000 0.85714286 0.40000000
#> [212,] 0.80000000 0.50000000 0.85714286 0.45714286 0.44285714
#> [213,] 0.55714286 1.00000000 0.84285714 0.81428571 0.48571429
#> [214,] 0.88571429 0.60000000 0.72857143 0.81428571 0.44285714
#> [215,] 0.28571429 0.48571429 1.00000000 1.00000000 0.82857143
#> [216,] 0.48571429 0.88571429 1.00000000 0.81428571 1.00000000
#> [217,] 0.27142857 0.71428571 0.11428571 0.92857143 0.94285714
#> [218,] 0.35714286 0.31428571 0.38571429 1.00000000 0.12857143
#> [219,] 0.95714286 0.48571429 0.94285714 0.65714286 0.81428571
#> [220,] 0.32857143 0.58571429 0.65714286 0.35714286 0.97142857
#> [221,] 0.71428571 0.45714286 0.67142857 0.25714286 0.97142857
#> [222,] 0.37142857 0.92857143 0.91428571 0.88571429 0.60000000
#> [223,] 0.58571429 0.87142857 0.81428571 0.28571429 0.94285714
#> [224,] 0.44285714 0.40000000 0.30000000 0.15714286 0.81428571
#> [225,] 0.30000000 0.58571429 0.54285714 0.50000000 0.81428571
#> [226,] 0.81428571 0.24285714 1.00000000 0.78571429 0.84285714
#> [227,] 0.95714286 0.70000000 0.75714286 0.98571429 0.64285714
#> [228,] 0.21428571 0.42857143 0.87142857 0.80000000 0.81428571
#> [229,] 0.37142857 1.00000000 0.42857143 0.42857143 1.00000000
#> [230,] 0.35714286 0.64285714 0.87142857 0.80000000 0.50000000
#> [231,] 0.71428571 0.48571429 1.00000000 1.00000000 0.82857143
#> [232,] 1.00000000 0.37142857 0.28571429 0.84285714 0.95714286
#> [233,] 0.62857143 0.61428571 0.82857143 0.81428571 0.11428571
#> [234,] 0.50000000 0.10000000 0.74285714 0.95714286 0.22857143
#> [235,] 0.40000000 0.91428571 0.24285714 0.07142857 0.75714286
#> [236,] 0.60000000 0.14285714 0.18571429 0.25714286 0.20000000
#> [237,] 0.92857143 0.48571429 1.00000000 0.87142857 0.15714286
#> [238,] 0.60000000 0.60000000 0.44285714 0.64285714 0.61428571
#> [239,] 0.62857143 0.44285714 0.80000000 0.74285714 0.11428571
#> [240,] 0.11428571 0.81428571 0.37142857 0.87142857 0.50000000
#> [241,] 0.88571429 1.00000000 0.15714286 0.74285714 1.00000000
#> [242,] 0.55714286 0.45714286 0.50000000 0.55714286 0.22857143
#> [243,] 0.50000000 0.47142857 0.60000000 0.94285714 0.92857143
#> [244,] 0.62857143 0.82857143 1.00000000 0.88571429 1.00000000
#> [245,] 0.61428571 0.77142857 0.14285714 0.82857143 0.51428571
#> [246,] 0.90000000 0.70000000 0.65714286 0.38571429 0.84285714
#> [247,] 0.18571429 0.71428571 0.74285714 0.37142857 0.21428571
#> [248,] 0.68571429 0.30000000 0.27142857 0.78571429 0.84285714
#> [249,] 0.55714286 0.55714286 1.00000000 1.00000000 0.28571429
#> [250,] 0.81428571 0.52857143 0.17142857 0.88571429 0.78571429
#> [251,] 0.71428571 0.80000000 0.41428571 1.00000000 0.60000000
#> [252,] 0.40000000 0.44285714 0.90000000 0.14285714 0.50000000
#> [253,] 0.35714286 0.81428571 0.12857143 0.81428571 0.77142857
#> [254,] 0.72857143 0.95714286 0.50000000 0.15714286 0.82857143
#> [255,] 0.52857143 0.41428571 0.77142857 0.82857143 0.14285714
#> [256,] 0.34285714 0.72857143 0.84285714 0.87142857 1.00000000
#> [257,] 0.97142857 0.80000000 0.94285714 0.65714286 0.01428571
#> [258,] 0.60000000 0.47142857 0.88571429 0.54285714 0.65714286
#> [259,] 0.84285714 0.20000000 1.00000000 0.85714286 0.15714286
#> [260,] 0.77142857 0.60000000 0.21428571 0.58571429 0.61428571
#> [261,] 0.78571429 0.55714286 0.84285714 0.24285714 1.00000000
#> [262,] 0.78571429 0.84285714 1.00000000 0.75714286 0.78571429
#> [263,] 0.48571429 0.62857143 1.00000000 1.00000000 0.57142857
#> [264,] 0.68571429 0.92857143 0.68571429 0.67142857 0.85714286
#> [265,] 0.88571429 1.00000000 0.40000000 0.37142857 0.74285714
#> [266,] 0.38571429 0.77142857 0.70000000 0.45714286 0.70000000
#> [267,] 1.00000000 0.72857143 0.10000000 0.05714286 0.94285714
#> [268,] 0.32857143 0.82857143 0.30000000 0.42857143 0.75714286
#> [269,] 0.42857143 0.67142857 1.00000000 0.31428571 0.47142857
#> [270,] 0.87142857 1.00000000 0.17142857 0.91428571 0.44285714
#> [271,] 0.75714286 0.78571429 0.87142857 0.11428571 1.00000000
#> [272,] 0.38571429 0.14285714 0.58571429 0.90000000 0.71428571
#> [273,] 0.60000000 1.00000000 0.67142857 0.91428571 0.07142857
#> [274,] 0.75714286 0.74285714 0.84285714 0.78571429 1.00000000
#> [275,] 0.71428571 0.90000000 0.07142857 0.67142857 0.47142857
#> [276,] 0.84285714 0.18571429 0.81428571 0.78571429 0.02857143
#> [277,] 0.25714286 0.72857143 0.55714286 0.50000000 0.84285714
#> [278,] 0.58571429 0.75714286 0.72857143 0.81428571 0.82857143
#> [279,] 0.84285714 0.80000000 1.00000000 0.80000000 0.57142857
#> [280,] 0.42857143 0.08571429 0.74285714 0.54285714 1.00000000
#> [281,] 0.34285714 0.71428571 0.47142857 0.70000000 0.87142857
#> [282,] 0.57142857 1.00000000 0.72857143 1.00000000 1.00000000
#> [283,] 0.40000000 0.58571429 0.68571429 0.71428571 0.30000000
#> [284,] 0.32857143 0.51428571 0.84285714 0.67142857 0.92857143
#> [285,] 0.91428571 0.55714286 0.15714286 1.00000000 0.77142857
#> [286,] 0.54285714 0.90000000 0.17142857 0.05714286 0.80000000
#> [287,] 0.65714286 0.21428571 0.80000000 0.47142857 0.84285714
#> [288,] 0.60000000 0.80000000 0.28571429 0.65714286 0.80000000
#> [289,] 0.48571429 0.87142857 0.95714286 1.00000000 0.57142857
#> [290,] 0.28571429 0.51428571 0.87142857 0.32857143 0.08571429
#> [291,] 0.68571429 0.57142857 0.85714286 0.45714286 0.81428571
#> [292,] 0.65714286 0.60000000 0.88571429 0.80000000 0.85714286
#> [293,] 0.55714286 0.81428571 0.70000000 0.44285714 0.77142857
#> [294,] 0.47142857 1.00000000 1.00000000 0.14285714 0.01428571
#> [295,] 0.77142857 0.60000000 0.78571429 0.42857143 0.87142857
#> [296,] 0.30000000 0.21428571 1.00000000 0.24285714 0.44285714
#> [297,] 0.40000000 1.00000000 1.00000000 0.84285714 1.00000000
#> [298,] 0.92857143 0.38571429 0.94285714 0.71428571 0.84285714
#> [299,] 0.88571429 0.48571429 0.94285714 0.75714286 0.22857143
#> [300,] 0.90000000 0.31428571 0.40000000 0.75714286 0.50000000
#> [301,] 0.50000000 0.15714286 0.65714286 0.82857143 0.01428571
#> [302,] 0.65714286 0.98571429 0.70000000 0.95714286 0.84285714
#> [303,] 0.78571429 0.75714286 0.85714286 1.00000000 0.75714286
#> [304,] 0.17142857 0.51428571 0.57142857 0.38571429 0.82857143
#> [305,] 0.81428571 0.62857143 0.52857143 0.31428571 0.78571429
#> [306,] 0.88571429 0.20000000 0.61428571 0.47142857 0.81428571
#> [307,] 0.90000000 0.80000000 0.05714286 1.00000000 0.25714286
#> [308,] 0.37142857 0.81428571 0.91428571 0.54285714 0.57142857
#> [309,] 0.38571429 0.81428571 0.75714286 0.54285714 0.47142857
#> [310,] 0.35714286 0.40000000 0.47142857 0.54285714 0.71428571
#> [311,] 0.61428571 0.92857143 0.95714286 0.84285714 0.42857143
#> [312,] 0.41428571 0.64285714 0.88571429 0.81428571 0.31428571
#> [313,] 0.88571429 0.62857143 0.87142857 0.07142857 0.65714286
#> [314,] 0.61428571 0.84285714 0.58571429 0.50000000 0.84285714
#> [315,] 0.38571429 0.77142857 0.32857143 0.00000000 1.00000000
#> [316,] 0.62857143 0.44285714 0.97142857 0.97142857 0.58571429
#> [317,] 0.60000000 0.42857143 0.40000000 0.88571429 0.82857143
#> [318,] 0.30000000 0.67142857 0.57142857 0.77142857 0.67142857
#> [319,] 0.38571429 0.27142857 1.00000000 0.20000000 1.00000000
#> [320,] 0.32857143 0.91428571 0.24285714 0.75714286 0.45714286
#> [321,] 0.15714286 0.22857143 0.51428571 0.57142857 0.92857143
#> [322,] 0.40000000 0.78571429 0.22857143 0.71428571 0.68571429
#> [323,] 0.42857143 0.41428571 0.84285714 0.47142857 0.44285714
#> [324,] 0.57142857 0.34285714 1.00000000 0.38571429 0.87142857
#> [325,] 0.58571429 0.64285714 0.87142857 0.38571429 0.17142857
#> [326,] 0.88571429 0.77142857 0.72857143 1.00000000 0.40000000
#> [327,] 0.37142857 0.44285714 0.74285714 0.85714286 0.37142857
#> [328,] 0.85714286 0.91428571 0.22857143 0.60000000 1.00000000
#> [329,] 0.25714286 0.65714286 0.28571429 0.94285714 0.42857143
#> [330,] 0.08571429 0.64285714 0.67142857 0.61428571 0.80000000
#> [331,] 0.68571429 0.82857143 0.70000000 0.91428571 0.68571429
#> [332,] 0.41428571 0.84285714 1.00000000 0.90000000 0.14285714
#> [333,] 0.32857143 0.58571429 0.72857143 0.81428571 1.00000000
#> [334,] 0.44285714 0.64285714 0.78571429 0.84285714 0.55714286
#> [335,] 0.77142857 0.91428571 0.55714286 0.98571429 0.17142857
#> [336,] 0.60000000 0.77142857 0.80000000 0.17142857 0.14285714
#> [337,] 0.48571429 0.80000000 1.00000000 0.81428571 0.80000000
#> [338,] 0.78571429 0.77142857 0.84285714 0.42857143 0.58571429
#> [339,] 0.71428571 0.98571429 0.72857143 0.58571429 0.31428571
#> [340,] 0.62857143 0.22857143 0.42857143 0.21428571 0.75714286
#> [341,] 0.67142857 1.00000000 0.87142857 0.07142857 0.78571429
#> [342,] 0.75714286 0.32857143 1.00000000 0.21428571 0.21428571
#> [343,] 0.85714286 0.15714286 0.18571429 0.15714286 0.40000000
#> [344,] 0.71428571 0.82857143 1.00000000 0.65714286 0.27142857
#> [345,] 0.27142857 0.58571429 1.00000000 0.20000000 0.17142857
#> [346,] 0.57142857 0.85714286 0.40000000 1.00000000 0.11428571
#> [347,] 0.60000000 0.07142857 0.95714286 0.58571429 0.38571429
#> [348,] 0.85714286 1.00000000 0.11428571 0.77142857 0.80000000
#> [349,] 0.91428571 0.55714286 0.80000000 0.78571429 0.15714286
#> [350,] 0.62857143 0.24285714 1.00000000 0.81428571 0.42857143
a$PPP_item_means
#>  [1] 0.5285714 0.5000000 0.4714286 0.4714286 0.5857143 0.5000000 0.5142857
#>  [8] 0.5571429 0.5142857 0.4857143 0.4571429 0.5142857 0.4000000 0.5428571
#> [15] 0.5714286 0.6571429 0.4714286 0.4857143 0.4142857 0.5142857 0.5142857
#> [22] 0.5428571 0.4571429 0.4000000 0.5000000 0.4571429 0.4142857 0.6000000
#> [29] 0.3714286 0.6285714 0.5571429 0.4714286 0.4857143 0.3714286 0.5571429
#> [36] 0.6142857 0.4857143 0.4571429 0.4285714 0.6000000 0.4714286 0.5285714
#> [43] 0.5000000 0.5000000 0.5000000 0.4142857 0.5000000 0.5285714 0.5142857
#> [50] 0.5571429
a$PPP_item_ORs
#>       [,1]      [,2]      [,3]      [,4]      [,5]       [,6]      [,7]
#>  [1,]   NA 0.4142857 0.5571429 0.2857143 0.6714286 0.95714286 0.4428571
#>  [2,]   NA        NA 0.9000000 0.5571429 0.8571429 0.34285714 0.4571429
#>  [3,]   NA        NA        NA 0.4142857 0.4857143 0.01428571 0.1428571
#>  [4,]   NA        NA        NA        NA 0.2142857 0.24285714 0.6714286
#>  [5,]   NA        NA        NA        NA        NA 0.55714286 0.6714286
#>  [6,]   NA        NA        NA        NA        NA         NA 0.4142857
#>  [7,]   NA        NA        NA        NA        NA         NA        NA
#>  [8,]   NA        NA        NA        NA        NA         NA        NA
#>  [9,]   NA        NA        NA        NA        NA         NA        NA
#> [10,]   NA        NA        NA        NA        NA         NA        NA
#> [11,]   NA        NA        NA        NA        NA         NA        NA
#> [12,]   NA        NA        NA        NA        NA         NA        NA
#> [13,]   NA        NA        NA        NA        NA         NA        NA
#> [14,]   NA        NA        NA        NA        NA         NA        NA
#> [15,]   NA        NA        NA        NA        NA         NA        NA
#> [16,]   NA        NA        NA        NA        NA         NA        NA
#> [17,]   NA        NA        NA        NA        NA         NA        NA
#> [18,]   NA        NA        NA        NA        NA         NA        NA
#> [19,]   NA        NA        NA        NA        NA         NA        NA
#> [20,]   NA        NA        NA        NA        NA         NA        NA
#> [21,]   NA        NA        NA        NA        NA         NA        NA
#> [22,]   NA        NA        NA        NA        NA         NA        NA
#> [23,]   NA        NA        NA        NA        NA         NA        NA
#> [24,]   NA        NA        NA        NA        NA         NA        NA
#> [25,]   NA        NA        NA        NA        NA         NA        NA
#> [26,]   NA        NA        NA        NA        NA         NA        NA
#> [27,]   NA        NA        NA        NA        NA         NA        NA
#> [28,]   NA        NA        NA        NA        NA         NA        NA
#> [29,]   NA        NA        NA        NA        NA         NA        NA
#> [30,]   NA        NA        NA        NA        NA         NA        NA
#> [31,]   NA        NA        NA        NA        NA         NA        NA
#> [32,]   NA        NA        NA        NA        NA         NA        NA
#> [33,]   NA        NA        NA        NA        NA         NA        NA
#> [34,]   NA        NA        NA        NA        NA         NA        NA
#> [35,]   NA        NA        NA        NA        NA         NA        NA
#> [36,]   NA        NA        NA        NA        NA         NA        NA
#> [37,]   NA        NA        NA        NA        NA         NA        NA
#> [38,]   NA        NA        NA        NA        NA         NA        NA
#> [39,]   NA        NA        NA        NA        NA         NA        NA
#> [40,]   NA        NA        NA        NA        NA         NA        NA
#> [41,]   NA        NA        NA        NA        NA         NA        NA
#> [42,]   NA        NA        NA        NA        NA         NA        NA
#> [43,]   NA        NA        NA        NA        NA         NA        NA
#> [44,]   NA        NA        NA        NA        NA         NA        NA
#> [45,]   NA        NA        NA        NA        NA         NA        NA
#> [46,]   NA        NA        NA        NA        NA         NA        NA
#> [47,]   NA        NA        NA        NA        NA         NA        NA
#> [48,]   NA        NA        NA        NA        NA         NA        NA
#> [49,]   NA        NA        NA        NA        NA         NA        NA
#> [50,]   NA        NA        NA        NA        NA         NA        NA
#>            [,8]      [,9]     [,10]     [,11]      [,12]      [,13]     [,14]
#>  [1,] 0.6571429 0.6142857 0.3428571 0.7571429 0.05714286 0.80000000 0.7857143
#>  [2,] 0.3285714 0.7428571 0.8142857 0.5142857 0.30000000 1.00000000 0.4000000
#>  [3,] 0.6857143 0.2142857 0.3142857 0.1142857 0.14285714 0.71428571 0.8857143
#>  [4,] 0.3857143 0.6857143 0.1857143 0.6142857 0.01428571 0.68571429 0.6142857
#>  [5,] 0.6428571 0.9428571 0.6428571 0.8428571 0.44285714 0.24285714 0.4857143
#>  [6,] 0.7000000 0.7857143 0.6428571 0.6857143 0.45714286 0.81428571 0.6285714
#>  [7,] 0.8142857 0.6428571 0.2571429 0.8714286 0.25714286 0.94285714 0.9714286
#>  [8,]        NA 0.1571429 0.4285714 0.4857143 0.31428571 0.91428571 0.4571429
#>  [9,]        NA        NA 0.5714286 0.4142857 0.45714286 0.77142857 0.2142857
#> [10,]        NA        NA        NA 0.7428571 0.21428571 0.94285714 0.4857143
#> [11,]        NA        NA        NA        NA 0.11428571 0.11428571 0.5000000
#> [12,]        NA        NA        NA        NA         NA 0.02857143 0.2142857
#> [13,]        NA        NA        NA        NA         NA         NA 0.3714286
#> [14,]        NA        NA        NA        NA         NA         NA        NA
#> [15,]        NA        NA        NA        NA         NA         NA        NA
#> [16,]        NA        NA        NA        NA         NA         NA        NA
#> [17,]        NA        NA        NA        NA         NA         NA        NA
#> [18,]        NA        NA        NA        NA         NA         NA        NA
#> [19,]        NA        NA        NA        NA         NA         NA        NA
#> [20,]        NA        NA        NA        NA         NA         NA        NA
#> [21,]        NA        NA        NA        NA         NA         NA        NA
#> [22,]        NA        NA        NA        NA         NA         NA        NA
#> [23,]        NA        NA        NA        NA         NA         NA        NA
#> [24,]        NA        NA        NA        NA         NA         NA        NA
#> [25,]        NA        NA        NA        NA         NA         NA        NA
#> [26,]        NA        NA        NA        NA         NA         NA        NA
#> [27,]        NA        NA        NA        NA         NA         NA        NA
#> [28,]        NA        NA        NA        NA         NA         NA        NA
#> [29,]        NA        NA        NA        NA         NA         NA        NA
#> [30,]        NA        NA        NA        NA         NA         NA        NA
#> [31,]        NA        NA        NA        NA         NA         NA        NA
#> [32,]        NA        NA        NA        NA         NA         NA        NA
#> [33,]        NA        NA        NA        NA         NA         NA        NA
#> [34,]        NA        NA        NA        NA         NA         NA        NA
#> [35,]        NA        NA        NA        NA         NA         NA        NA
#> [36,]        NA        NA        NA        NA         NA         NA        NA
#> [37,]        NA        NA        NA        NA         NA         NA        NA
#> [38,]        NA        NA        NA        NA         NA         NA        NA
#> [39,]        NA        NA        NA        NA         NA         NA        NA
#> [40,]        NA        NA        NA        NA         NA         NA        NA
#> [41,]        NA        NA        NA        NA         NA         NA        NA
#> [42,]        NA        NA        NA        NA         NA         NA        NA
#> [43,]        NA        NA        NA        NA         NA         NA        NA
#> [44,]        NA        NA        NA        NA         NA         NA        NA
#> [45,]        NA        NA        NA        NA         NA         NA        NA
#> [46,]        NA        NA        NA        NA         NA         NA        NA
#> [47,]        NA        NA        NA        NA         NA         NA        NA
#> [48,]        NA        NA        NA        NA         NA         NA        NA
#> [49,]        NA        NA        NA        NA         NA         NA        NA
#> [50,]        NA        NA        NA        NA         NA         NA        NA
#>           [,15]      [,16]     [,17]      [,18]      [,19]      [,20]
#>  [1,] 0.3000000 0.27142857 0.8142857 0.75714286 0.87142857 0.82857143
#>  [2,] 0.5571429 0.44285714 0.3571429 0.11428571 0.21428571 0.88571429
#>  [3,] 0.8142857 0.14285714 0.3000000 0.00000000 0.05714286 0.75714286
#>  [4,] 0.3714286 0.08571429 0.2428571 0.02857143 0.25714286 0.42857143
#>  [5,] 0.7428571 0.21428571 0.2857143 0.78571429 0.10000000 0.35714286
#>  [6,] 0.8285714 0.42857143 0.4142857 0.07142857 0.08571429 0.61428571
#>  [7,] 0.5285714 0.57142857 0.7000000 0.22857143 0.60000000 0.58571429
#>  [8,] 0.9428571 0.50000000 0.3142857 0.12857143 0.30000000 0.44285714
#>  [9,] 0.5857143 0.05714286 0.4285714 0.18571429 0.24285714 0.27142857
#> [10,] 0.9428571 0.21428571 0.4428571 0.08571429 0.07142857 0.12857143
#> [11,] 0.4142857 0.40000000 0.6428571 0.77142857 0.52857143 0.08571429
#> [12,] 0.6714286 0.07142857 0.7571429 0.10000000 0.42857143 0.51428571
#> [13,] 0.5714286 0.75714286 0.1285714 0.17142857 0.15714286 0.68571429
#> [14,] 0.2428571 0.92857143 0.6000000 0.48571429 0.44285714 0.48571429
#> [15,]        NA 0.60000000 0.9857143 0.30000000 0.24285714 0.61428571
#> [16,]        NA         NA 0.3857143 0.85714286 0.25714286 0.28571429
#> [17,]        NA         NA        NA 0.72857143 0.92857143 0.94285714
#> [18,]        NA         NA        NA         NA 0.78571429 0.64285714
#> [19,]        NA         NA        NA         NA         NA 0.45714286
#> [20,]        NA         NA        NA         NA         NA         NA
#> [21,]        NA         NA        NA         NA         NA         NA
#> [22,]        NA         NA        NA         NA         NA         NA
#> [23,]        NA         NA        NA         NA         NA         NA
#> [24,]        NA         NA        NA         NA         NA         NA
#> [25,]        NA         NA        NA         NA         NA         NA
#> [26,]        NA         NA        NA         NA         NA         NA
#> [27,]        NA         NA        NA         NA         NA         NA
#> [28,]        NA         NA        NA         NA         NA         NA
#> [29,]        NA         NA        NA         NA         NA         NA
#> [30,]        NA         NA        NA         NA         NA         NA
#> [31,]        NA         NA        NA         NA         NA         NA
#> [32,]        NA         NA        NA         NA         NA         NA
#> [33,]        NA         NA        NA         NA         NA         NA
#> [34,]        NA         NA        NA         NA         NA         NA
#> [35,]        NA         NA        NA         NA         NA         NA
#> [36,]        NA         NA        NA         NA         NA         NA
#> [37,]        NA         NA        NA         NA         NA         NA
#> [38,]        NA         NA        NA         NA         NA         NA
#> [39,]        NA         NA        NA         NA         NA         NA
#> [40,]        NA         NA        NA         NA         NA         NA
#> [41,]        NA         NA        NA         NA         NA         NA
#> [42,]        NA         NA        NA         NA         NA         NA
#> [43,]        NA         NA        NA         NA         NA         NA
#> [44,]        NA         NA        NA         NA         NA         NA
#> [45,]        NA         NA        NA         NA         NA         NA
#> [46,]        NA         NA        NA         NA         NA         NA
#> [47,]        NA         NA        NA         NA         NA         NA
#> [48,]        NA         NA        NA         NA         NA         NA
#> [49,]        NA         NA        NA         NA         NA         NA
#> [50,]        NA         NA        NA         NA         NA         NA
#>            [,21]      [,22]      [,23]      [,24]      [,25]      [,26]
#>  [1,] 0.71428571 0.55714286 0.54285714 1.00000000 0.61428571 0.52857143
#>  [2,] 0.30000000 0.38571429 0.87142857 0.90000000 0.47142857 0.65714286
#>  [3,] 0.28571429 0.34285714 0.81428571 0.55714286 0.54285714 0.68571429
#>  [4,] 0.37142857 0.68571429 0.54285714 0.32857143 0.27142857 0.82857143
#>  [5,] 0.61428571 0.18571429 0.94285714 0.85714286 0.34285714 0.85714286
#>  [6,] 0.41428571 0.55714286 0.48571429 0.90000000 0.35714286 0.32857143
#>  [7,] 0.72857143 0.67142857 0.31428571 0.91428571 0.37142857 0.80000000
#>  [8,] 0.34285714 0.02857143 0.25714286 0.11428571 0.15714286 0.88571429
#>  [9,] 0.52857143 0.70000000 0.61428571 0.32857143 0.20000000 0.38571429
#> [10,] 0.00000000 0.21428571 0.01428571 0.60000000 0.27142857 0.20000000
#> [11,] 0.45714286 0.71428571 0.61428571 0.07142857 0.08571429 0.37142857
#> [12,] 0.14285714 0.44285714 0.30000000 0.82857143 0.15714286 0.20000000
#> [13,] 0.81428571 0.68571429 0.70000000 0.64285714 0.62857143 0.55714286
#> [14,] 0.08571429 1.00000000 0.30000000 0.48571429 0.74285714 0.08571429
#> [15,] 0.20000000 0.77142857 0.05714286 0.47142857 0.01428571 0.50000000
#> [16,] 0.72857143 0.62857143 0.24285714 0.50000000 0.51428571 0.05714286
#> [17,] 0.80000000 0.77142857 0.44285714 0.78571429 0.68571429 0.50000000
#> [18,] 0.54285714 0.12857143 0.50000000 0.10000000 0.51428571 0.15714286
#> [19,] 0.60000000 0.62857143 0.34285714 0.27142857 0.91428571 0.54285714
#> [20,] 0.70000000 0.91428571 0.67142857 0.30000000 0.34285714 0.44285714
#> [21,]         NA 0.95714286 0.88571429 0.70000000 0.14285714 0.52857143
#> [22,]         NA         NA 0.95714286 0.67142857 0.18571429 0.45714286
#> [23,]         NA         NA         NA 0.02857143 0.34285714 0.72857143
#> [24,]         NA         NA         NA         NA 0.54285714 0.31428571
#> [25,]         NA         NA         NA         NA         NA 0.14285714
#> [26,]         NA         NA         NA         NA         NA         NA
#> [27,]         NA         NA         NA         NA         NA         NA
#> [28,]         NA         NA         NA         NA         NA         NA
#> [29,]         NA         NA         NA         NA         NA         NA
#> [30,]         NA         NA         NA         NA         NA         NA
#> [31,]         NA         NA         NA         NA         NA         NA
#> [32,]         NA         NA         NA         NA         NA         NA
#> [33,]         NA         NA         NA         NA         NA         NA
#> [34,]         NA         NA         NA         NA         NA         NA
#> [35,]         NA         NA         NA         NA         NA         NA
#> [36,]         NA         NA         NA         NA         NA         NA
#> [37,]         NA         NA         NA         NA         NA         NA
#> [38,]         NA         NA         NA         NA         NA         NA
#> [39,]         NA         NA         NA         NA         NA         NA
#> [40,]         NA         NA         NA         NA         NA         NA
#> [41,]         NA         NA         NA         NA         NA         NA
#> [42,]         NA         NA         NA         NA         NA         NA
#> [43,]         NA         NA         NA         NA         NA         NA
#> [44,]         NA         NA         NA         NA         NA         NA
#> [45,]         NA         NA         NA         NA         NA         NA
#> [46,]         NA         NA         NA         NA         NA         NA
#> [47,]         NA         NA         NA         NA         NA         NA
#> [48,]         NA         NA         NA         NA         NA         NA
#> [49,]         NA         NA         NA         NA         NA         NA
#> [50,]         NA         NA         NA         NA         NA         NA
#>            [,27]     [,28]     [,29]      [,30]      [,31]      [,32]
#>  [1,] 0.44285714 0.9000000 0.9142857 0.10000000 0.74285714 0.97142857
#>  [2,] 0.54285714 0.8857143 0.8857143 0.14285714 0.34285714 0.32857143
#>  [3,] 0.84285714 0.2571429 0.8285714 0.68571429 0.04285714 0.78571429
#>  [4,] 0.52857143 0.5285714 0.2714286 0.51428571 0.45714286 0.41428571
#>  [5,] 0.41428571 0.8285714 1.0000000 0.11428571 0.98571429 0.57142857
#>  [6,] 0.25714286 0.6142857 0.6000000 0.17142857 0.75714286 0.48571429
#>  [7,] 0.55714286 0.9714286 0.8857143 0.14285714 0.25714286 0.84285714
#>  [8,] 0.15714286 0.3000000 0.6714286 0.00000000 0.28571429 0.20000000
#>  [9,] 0.52857143 0.2142857 0.8000000 0.38571429 0.67142857 0.01428571
#> [10,] 0.75714286 0.5142857 0.5428571 0.60000000 0.67142857 0.17142857
#> [11,] 0.24285714 0.6571429 0.7142857 0.50000000 0.30000000 0.28571429
#> [12,] 0.75714286 0.6000000 0.5571429 0.44285714 0.31428571 0.42857143
#> [13,] 0.37142857 0.7428571 0.5857143 0.41428571 0.24285714 0.34285714
#> [14,] 0.68571429 0.7000000 0.5000000 0.27142857 0.20000000 0.81428571
#> [15,] 0.94285714 0.6714286 0.7857143 0.37142857 0.71428571 0.31428571
#> [16,] 0.40000000 0.9714286 0.3857143 0.40000000 0.17142857 0.72857143
#> [17,] 0.67142857 0.9857143 0.8857143 0.44285714 0.90000000 0.88571429
#> [18,] 0.20000000 0.8714286 0.9428571 0.68571429 0.82857143 0.37142857
#> [19,] 0.31428571 1.0000000 0.9714286 0.31428571 0.70000000 0.44285714
#> [20,] 0.12857143 0.5285714 0.7571429 0.30000000 0.70000000 0.77142857
#> [21,] 0.78571429 0.5142857 0.3857143 0.57142857 0.28571429 0.35714286
#> [22,] 0.61428571 0.3000000 0.8571429 0.60000000 0.77142857 0.68571429
#> [23,] 0.52857143 0.3571429 0.4571429 0.27142857 0.17142857 0.28571429
#> [24,] 0.82857143 0.6571429 0.4571429 0.51428571 0.75714286 0.52857143
#> [25,] 0.02857143 0.5000000 0.1571429 0.90000000 0.92857143 0.95714286
#> [26,] 0.41428571 0.2428571 0.5000000 0.81428571 0.58571429 0.41428571
#> [27,]         NA 0.2428571 0.3000000 0.57142857 0.08571429 0.11428571
#> [28,]         NA        NA 0.9142857 0.25714286 0.54285714 0.88571429
#> [29,]         NA        NA        NA 0.04285714 0.72857143 0.14285714
#> [30,]         NA        NA        NA         NA 0.08571429 0.25714286
#> [31,]         NA        NA        NA         NA         NA 0.35714286
#> [32,]         NA        NA        NA         NA         NA         NA
#> [33,]         NA        NA        NA         NA         NA         NA
#> [34,]         NA        NA        NA         NA         NA         NA
#> [35,]         NA        NA        NA         NA         NA         NA
#> [36,]         NA        NA        NA         NA         NA         NA
#> [37,]         NA        NA        NA         NA         NA         NA
#> [38,]         NA        NA        NA         NA         NA         NA
#> [39,]         NA        NA        NA         NA         NA         NA
#> [40,]         NA        NA        NA         NA         NA         NA
#> [41,]         NA        NA        NA         NA         NA         NA
#> [42,]         NA        NA        NA         NA         NA         NA
#> [43,]         NA        NA        NA         NA         NA         NA
#> [44,]         NA        NA        NA         NA         NA         NA
#> [45,]         NA        NA        NA         NA         NA         NA
#> [46,]         NA        NA        NA         NA         NA         NA
#> [47,]         NA        NA        NA         NA         NA         NA
#> [48,]         NA        NA        NA         NA         NA         NA
#> [49,]         NA        NA        NA         NA         NA         NA
#> [50,]         NA        NA        NA         NA         NA         NA
#>            [,33]      [,34]      [,35]      [,36]      [,37]      [,38]
#>  [1,] 0.55714286 0.40000000 0.88571429 0.70000000 0.57142857 0.88571429
#>  [2,] 0.70000000 0.14285714 0.67142857 0.97142857 0.48571429 0.28571429
#>  [3,] 0.37142857 0.60000000 0.00000000 0.64285714 0.10000000 0.12857143
#>  [4,] 0.32857143 0.18571429 0.27142857 0.81428571 0.65714286 0.08571429
#>  [5,] 0.88571429 0.48571429 0.55714286 0.85714286 0.64285714 0.95714286
#>  [6,] 0.32857143 0.12857143 0.42857143 0.60000000 0.77142857 0.10000000
#>  [7,] 0.62857143 0.31428571 0.57142857 0.71428571 0.68571429 0.34285714
#>  [8,] 0.21428571 0.47142857 0.47142857 0.18571429 0.87142857 0.65714286
#>  [9,] 0.14285714 0.31428571 0.51428571 0.78571429 0.64285714 0.67142857
#> [10,] 0.04285714 0.32857143 0.48571429 0.40000000 0.68571429 0.42857143
#> [11,] 0.44285714 0.44285714 0.18571429 0.52857143 0.72857143 0.70000000
#> [12,] 0.80000000 0.17142857 0.74285714 0.05714286 0.90000000 0.07142857
#> [13,] 0.62857143 0.40000000 0.62857143 0.77142857 0.52857143 0.48571429
#> [14,] 0.75714286 0.62857143 0.02857143 0.44285714 0.24285714 0.15714286
#> [15,] 0.91428571 0.37142857 0.54285714 0.08571429 0.71428571 0.52857143
#> [16,] 0.98571429 0.02857143 0.15714286 0.78571429 0.71428571 0.05714286
#> [17,] 0.97142857 0.21428571 0.82857143 0.70000000 0.87142857 0.71428571
#> [18,] 0.84285714 0.51428571 0.61428571 0.17142857 0.91428571 0.87142857
#> [19,] 0.70000000 0.12857143 0.07142857 0.15714286 0.37142857 0.71428571
#> [20,] 0.44285714 0.18571429 0.21428571 0.80000000 0.98571429 0.27142857
#> [21,] 0.38571429 0.62857143 0.27142857 0.34285714 0.55714286 0.22857143
#> [22,] 0.32857143 0.34285714 0.41428571 0.98571429 0.08571429 0.12857143
#> [23,] 0.37142857 0.75714286 0.60000000 0.72857143 1.00000000 0.14285714
#> [24,] 0.30000000 0.38571429 0.80000000 0.88571429 0.74285714 0.30000000
#> [25,] 0.55714286 0.37142857 0.44285714 0.77142857 0.88571429 0.75714286
#> [26,] 0.71428571 0.22857143 0.34285714 0.28571429 0.81428571 0.14285714
#> [27,] 0.12857143 0.57142857 0.12857143 0.80000000 0.35714286 0.17142857
#> [28,] 0.10000000 0.77142857 0.01428571 0.82857143 0.92857143 0.55714286
#> [29,] 0.15714286 0.51428571 0.28571429 0.18571429 0.34285714 0.25714286
#> [30,] 0.27142857 0.40000000 0.35714286 0.32857143 0.54285714 0.22857143
#> [31,] 1.00000000 0.34285714 0.32857143 0.25714286 0.40000000 0.67142857
#> [32,] 0.44285714 0.75714286 0.48571429 0.61428571 0.50000000 0.55714286
#> [33,]         NA 0.11428571 0.77142857 0.62857143 0.74285714 0.87142857
#> [34,]         NA         NA 0.21428571 0.61428571 0.34285714 0.45714286
#> [35,]         NA         NA         NA 0.68571429 0.84285714 0.28571429
#> [36,]         NA         NA         NA         NA 0.54285714 0.62857143
#> [37,]         NA         NA         NA         NA         NA 0.37142857
#> [38,]         NA         NA         NA         NA         NA         NA
#> [39,]         NA         NA         NA         NA         NA         NA
#> [40,]         NA         NA         NA         NA         NA         NA
#> [41,]         NA         NA         NA         NA         NA         NA
#> [42,]         NA         NA         NA         NA         NA         NA
#> [43,]         NA         NA         NA         NA         NA         NA
#> [44,]         NA         NA         NA         NA         NA         NA
#> [45,]         NA         NA         NA         NA         NA         NA
#> [46,]         NA         NA         NA         NA         NA         NA
#> [47,]         NA         NA         NA         NA         NA         NA
#> [48,]         NA         NA         NA         NA         NA         NA
#> [49,]         NA         NA         NA         NA         NA         NA
#> [50,]         NA         NA         NA         NA         NA         NA
#>            [,39]      [,40]      [,41]     [,42]     [,43]     [,44]     [,45]
#>  [1,] 0.98571429 0.94285714 0.17142857 1.0000000 0.9428571 1.0000000 0.4714286
#>  [2,] 0.27142857 0.45714286 1.00000000 0.9142857 0.6857143 0.3000000 0.3142857
#>  [3,] 0.84285714 0.40000000 0.72857143 0.4285714 0.8142857 0.2428571 0.3571429
#>  [4,] 0.52857143 0.61428571 0.37142857 0.9571429 0.2000000 0.7571429 0.0000000
#>  [5,] 0.90000000 1.00000000 0.48571429 1.0000000 0.9714286 0.7142857 0.9000000
#>  [6,] 0.61428571 0.27142857 0.48571429 0.8714286 0.7571429 0.6714286 0.2428571
#>  [7,] 0.98571429 0.97142857 0.74285714 0.8571429 0.9857143 0.1571429 0.8857143
#>  [8,] 0.84285714 0.92857143 0.77142857 0.7714286 0.6714286 0.8142857 0.8857143
#>  [9,] 0.47142857 0.28571429 0.68571429 0.8714286 0.3857143 0.4571429 0.6285714
#> [10,] 0.81428571 0.47142857 0.78571429 0.9000000 0.5000000 0.5000000 0.2428571
#> [11,] 0.61428571 0.71428571 0.41428571 0.7285714 0.2857143 0.7285714 0.4571429
#> [12,] 0.10000000 0.20000000 0.57142857 0.6142857 0.7000000 0.7142857 0.9571429
#> [13,] 0.30000000 0.08571429 0.77142857 0.7142857 0.7285714 0.4714286 0.7571429
#> [14,] 0.51428571 0.22857143 0.64285714 0.8000000 0.6285714 0.5428571 0.8285714
#> [15,] 0.10000000 0.61428571 0.94285714 0.7571429 0.8714286 0.7714286 0.5142857
#> [16,] 0.15714286 0.78571429 0.34285714 0.7857143 0.8000000 0.4142857 0.2285714
#> [17,] 0.10000000 0.94285714 0.65714286 0.8571429 1.0000000 0.9571429 0.2142857
#> [18,] 0.28571429 0.75714286 0.58571429 0.8285714 0.3571429 0.6714286 0.8857143
#> [19,] 0.04285714 0.48571429 0.75714286 0.2142857 0.9285714 0.3714286 0.7714286
#> [20,] 0.30000000 0.47142857 0.75714286 1.0000000 0.8142857 0.6000000 0.7571429
#> [21,] 0.18571429 0.71428571 0.25714286 0.8142857 0.7428571 0.7285714 0.4428571
#> [22,] 0.28571429 0.65714286 0.34285714 0.5285714 0.7000000 0.5000000 0.2714286
#> [23,] 0.44285714 0.15714286 0.14285714 0.4714286 0.3857143 0.2142857 0.1000000
#> [24,] 0.88571429 0.94285714 0.64285714 0.8428571 0.6857143 0.9000000 0.7000000
#> [25,] 0.11428571 0.78571429 0.17142857 0.9714286 0.9000000 0.9000000 0.5428571
#> [26,] 0.60000000 0.51428571 0.81428571 0.3571429 0.6428571 0.9571429 0.6571429
#> [27,] 0.74285714 0.05714286 0.74285714 0.6857143 0.4714286 0.1000000 0.4000000
#> [28,] 0.84285714 0.85714286 0.54285714 0.4857143 0.5571429 0.8714286 0.1142857
#> [29,] 0.50000000 0.71428571 0.98571429 0.2714286 0.9000000 0.9000000 0.7571429
#> [30,] 0.21428571 0.64285714 0.04285714 0.2000000 0.2714286 0.5714286 0.3571429
#> [31,] 0.14285714 0.41428571 0.40000000 0.9428571 0.3571429 0.7000000 0.2142857
#> [32,] 0.04285714 0.81428571 0.45714286 0.9714286 0.7571429 0.7857143 0.6714286
#> [33,] 0.22857143 0.71428571 0.51428571 0.3142857 0.1142857 0.3571429 0.1285714
#> [34,] 0.45714286 0.32857143 0.24285714 0.7428571 0.5857143 0.1142857 0.4142857
#> [35,] 0.31428571 0.61428571 0.08571429 0.9571429 0.4142857 0.6571429 0.3428571
#> [36,] 0.40000000 0.78571429 0.25714286 0.6428571 0.7000000 0.6000000 0.3000000
#> [37,] 0.32857143 0.62857143 0.02857143 0.8571429 0.4000000 0.3857143 0.2857143
#> [38,] 0.55714286 0.18571429 0.77142857 0.8714286 0.1857143 0.5857143 0.6285714
#> [39,]         NA 0.00000000 0.18571429 0.5571429 0.9714286 0.3000000 0.3714286
#> [40,]         NA         NA 0.14285714 0.7142857 0.9428571 0.4142857 0.5285714
#> [41,]         NA         NA         NA 0.7857143 0.3571429 0.5714286 0.7285714
#> [42,]         NA         NA         NA        NA 0.9571429 1.0000000 0.1000000
#> [43,]         NA         NA         NA        NA        NA 0.6000000 0.3857143
#> [44,]         NA         NA         NA        NA        NA        NA 0.7857143
#> [45,]         NA         NA         NA        NA        NA        NA        NA
#> [46,]         NA         NA         NA        NA        NA        NA        NA
#> [47,]         NA         NA         NA        NA        NA        NA        NA
#> [48,]         NA         NA         NA        NA        NA        NA        NA
#> [49,]         NA         NA         NA        NA        NA        NA        NA
#> [50,]         NA         NA         NA        NA        NA        NA        NA
#>           [,46]      [,47]     [,48]      [,49]      [,50]
#>  [1,] 0.7714286 0.47142857 0.7428571 0.51428571 0.90000000
#>  [2,] 1.0000000 0.70000000 0.4857143 0.54285714 1.00000000
#>  [3,] 0.5000000 0.71428571 0.4000000 0.21428571 0.84285714
#>  [4,] 0.1571429 0.38571429 0.9142857 0.12857143 0.67142857
#>  [5,] 0.5714286 0.97142857 0.9571429 0.85714286 0.90000000
#>  [6,] 0.8571429 0.48571429 0.7428571 0.91428571 0.52857143
#>  [7,] 0.8000000 0.05714286 0.9142857 0.27142857 0.88571429
#>  [8,] 0.5571429 0.41428571 0.9857143 0.41428571 0.55714286
#>  [9,] 0.1571429 0.55714286 0.6428571 0.60000000 0.37142857
#> [10,] 0.5857143 0.62857143 0.4000000 0.37142857 0.52857143
#> [11,] 0.4714286 0.10000000 0.4571429 0.08571429 0.11428571
#> [12,] 0.9857143 0.58571429 0.2571429 0.11428571 0.52857143
#> [13,] 0.6142857 0.12857143 0.3571429 0.38571429 0.67142857
#> [14,] 0.5714286 0.52857143 0.7857143 0.04285714 0.87142857
#> [15,] 0.4857143 0.07142857 0.5000000 0.20000000 0.48571429
#> [16,] 0.2428571 0.15714286 0.0000000 0.40000000 0.01428571
#> [17,] 0.9714286 0.17142857 0.8714286 0.25714286 0.55714286
#> [18,] 0.3285714 0.02857143 0.3857143 0.54285714 0.08571429
#> [19,] 0.8285714 0.05714286 0.8428571 0.11428571 0.34285714
#> [20,] 0.9857143 0.22857143 0.9857143 0.61428571 0.95714286
#> [21,] 0.2714286 0.12857143 0.6857143 0.17142857 0.70000000
#> [22,] 0.4142857 0.08571429 0.6285714 0.67142857 0.44285714
#> [23,] 0.3571429 0.00000000 0.2142857 0.52857143 0.34285714
#> [24,] 0.8714286 0.68571429 0.6571429 0.31428571 0.61428571
#> [25,] 0.9857143 0.10000000 0.9000000 0.67142857 0.31428571
#> [26,] 0.9428571 0.24285714 0.8571429 0.81428571 0.71428571
#> [27,] 0.5857143 0.27142857 0.5571429 0.45714286 0.82857143
#> [28,] 0.5571429 0.14285714 0.6000000 0.62857143 0.08571429
#> [29,] 0.6000000 0.57142857 0.7142857 0.81428571 0.75714286
#> [30,] 0.5428571 0.12857143 0.5714286 0.62857143 0.51428571
#> [31,] 0.4714286 0.38571429 0.8857143 0.62857143 0.61428571
#> [32,] 0.9000000 0.54285714 0.9142857 0.87142857 0.70000000
#> [33,] 0.5285714 0.35714286 0.2000000 0.15714286 0.21428571
#> [34,] 0.8428571 0.20000000 0.2142857 0.31428571 0.35714286
#> [35,] 0.3285714 0.82857143 0.8285714 0.71428571 0.25714286
#> [36,] 0.5571429 0.77142857 0.7142857 0.90000000 0.75714286
#> [37,] 1.0000000 0.24285714 0.9714286 0.48571429 0.55714286
#> [38,] 0.4714286 0.85714286 0.8857143 0.64285714 0.78571429
#> [39,] 0.4571429 0.22857143 0.6571429 0.91428571 0.58571429
#> [40,] 0.1142857 0.22857143 1.0000000 0.52857143 0.28571429
#> [41,] 0.6857143 1.00000000 0.8857143 0.82857143 0.80000000
#> [42,] 0.9285714 0.32857143 0.6714286 0.54285714 0.60000000
#> [43,] 0.8142857 0.37142857 0.5857143 0.61428571 0.38571429
#> [44,] 0.2428571 0.75714286 0.6571429 0.45714286 0.75714286
#> [45,] 0.7428571 0.87142857 0.3857143 0.75714286 0.65714286
#> [46,]        NA 0.28571429 0.3428571 0.50000000 0.84285714
#> [47,]        NA         NA 0.5857143 0.40000000 0.88571429
#> [48,]        NA         NA        NA 0.50000000 0.85714286
#> [49,]        NA         NA        NA         NA 0.62857143
#> [50,]        NA         NA        NA         NA         NA
mean(a$PPP_total_scores)
#> [1] 0.6262694
mean(upper.tri(a$PPP_item_ORs))
#> [1] 0.49
mean(a$PPP_item_means)
#> [1] 0.5017143

(3) Evaluate the accuracy of estimated parameters

Attribute-wise agreement rate between true and estimated alphas

AAR_vec <- numeric(L)
for(t in 1:L){
  AAR_vec[t] <- mean(Alphas[,,t]==a$Alphas_est[,,t])
}
AAR_vec
#> [1] 0.9307143 0.9585714 0.9700000 0.9871429 0.9842857

Pattern-wise agreement rate between true and estimated alphas

PAR_vec <- numeric(L)
for(t in 1:L){
  PAR_vec[t] <- mean(rowSums((Alphas[,,t]-a$Alphas_est[,,t])^2)==0)
}
PAR_vec
#> [1] 0.7457143 0.8514286 0.8885714 0.9485714 0.9457143

(4) Evaluate the fit of the model to the observed response

a$DIC
#>              Transition Response_Time Response    Joint    Total
#> D_bar          1591.022            NA 14617.45 1920.522 18129.00
#> D(theta_bar)   1377.416            NA 14124.77 1913.581 17415.76
#> DIC            1804.627            NA 15110.14 1927.463 18842.23

head(a$PPP_total_scores)
#>           [,1]      [,2]      [,3]      [,4]      [,5]
#> [1,] 0.2857143 0.6857143 0.8857143 0.7000000 0.8142857
#> [2,] 0.9857143 0.2428571 0.4714286 0.7000000 0.4142857
#> [3,] 0.3571429 0.7285714 0.9714286 0.5857143 0.4428571
#> [4,] 0.6714286 0.6571429 0.2857143 0.2428571 1.0000000
#> [5,] 0.9000000 0.4571429 0.5142857 0.8142857 0.4714286
#> [6,] 0.6000000 0.3428571 0.7714286 0.1285714 0.4571429
head(a$PPP_item_means)
#> [1] 0.5285714 0.5000000 0.4714286 0.4714286 0.5857143 0.5000000
head(a$PPP_item_ORs)
#>      [,1]      [,2]      [,3]      [,4]      [,5]       [,6]      [,7]
#> [1,]   NA 0.4142857 0.5571429 0.2857143 0.6714286 0.95714286 0.4428571
#> [2,]   NA        NA 0.9000000 0.5571429 0.8571429 0.34285714 0.4571429
#> [3,]   NA        NA        NA 0.4142857 0.4857143 0.01428571 0.1428571
#> [4,]   NA        NA        NA        NA 0.2142857 0.24285714 0.6714286
#> [5,]   NA        NA        NA        NA        NA 0.55714286 0.6714286
#> [6,]   NA        NA        NA        NA        NA         NA 0.4142857
#>           [,8]      [,9]     [,10]     [,11]      [,12]     [,13]     [,14]
#> [1,] 0.6571429 0.6142857 0.3428571 0.7571429 0.05714286 0.8000000 0.7857143
#> [2,] 0.3285714 0.7428571 0.8142857 0.5142857 0.30000000 1.0000000 0.4000000
#> [3,] 0.6857143 0.2142857 0.3142857 0.1142857 0.14285714 0.7142857 0.8857143
#> [4,] 0.3857143 0.6857143 0.1857143 0.6142857 0.01428571 0.6857143 0.6142857
#> [5,] 0.6428571 0.9428571 0.6428571 0.8428571 0.44285714 0.2428571 0.4857143
#> [6,] 0.7000000 0.7857143 0.6428571 0.6857143 0.45714286 0.8142857 0.6285714
#>          [,15]      [,16]     [,17]      [,18]      [,19]     [,20]     [,21]
#> [1,] 0.3000000 0.27142857 0.8142857 0.75714286 0.87142857 0.8285714 0.7142857
#> [2,] 0.5571429 0.44285714 0.3571429 0.11428571 0.21428571 0.8857143 0.3000000
#> [3,] 0.8142857 0.14285714 0.3000000 0.00000000 0.05714286 0.7571429 0.2857143
#> [4,] 0.3714286 0.08571429 0.2428571 0.02857143 0.25714286 0.4285714 0.3714286
#> [5,] 0.7428571 0.21428571 0.2857143 0.78571429 0.10000000 0.3571429 0.6142857
#> [6,] 0.8285714 0.42857143 0.4142857 0.07142857 0.08571429 0.6142857 0.4142857
#>          [,22]     [,23]     [,24]     [,25]     [,26]     [,27]     [,28]
#> [1,] 0.5571429 0.5428571 1.0000000 0.6142857 0.5285714 0.4428571 0.9000000
#> [2,] 0.3857143 0.8714286 0.9000000 0.4714286 0.6571429 0.5428571 0.8857143
#> [3,] 0.3428571 0.8142857 0.5571429 0.5428571 0.6857143 0.8428571 0.2571429
#> [4,] 0.6857143 0.5428571 0.3285714 0.2714286 0.8285714 0.5285714 0.5285714
#> [5,] 0.1857143 0.9428571 0.8571429 0.3428571 0.8571429 0.4142857 0.8285714
#> [6,] 0.5571429 0.4857143 0.9000000 0.3571429 0.3285714 0.2571429 0.6142857
#>          [,29]     [,30]      [,31]     [,32]     [,33]     [,34]     [,35]
#> [1,] 0.9142857 0.1000000 0.74285714 0.9714286 0.5571429 0.4000000 0.8857143
#> [2,] 0.8857143 0.1428571 0.34285714 0.3285714 0.7000000 0.1428571 0.6714286
#> [3,] 0.8285714 0.6857143 0.04285714 0.7857143 0.3714286 0.6000000 0.0000000
#> [4,] 0.2714286 0.5142857 0.45714286 0.4142857 0.3285714 0.1857143 0.2714286
#> [5,] 1.0000000 0.1142857 0.98571429 0.5714286 0.8857143 0.4857143 0.5571429
#> [6,] 0.6000000 0.1714286 0.75714286 0.4857143 0.3285714 0.1285714 0.4285714
#>          [,36]     [,37]      [,38]     [,39]     [,40]     [,41]     [,42]
#> [1,] 0.7000000 0.5714286 0.88571429 0.9857143 0.9428571 0.1714286 1.0000000
#> [2,] 0.9714286 0.4857143 0.28571429 0.2714286 0.4571429 1.0000000 0.9142857
#> [3,] 0.6428571 0.1000000 0.12857143 0.8428571 0.4000000 0.7285714 0.4285714
#> [4,] 0.8142857 0.6571429 0.08571429 0.5285714 0.6142857 0.3714286 0.9571429
#> [5,] 0.8571429 0.6428571 0.95714286 0.9000000 1.0000000 0.4857143 1.0000000
#> [6,] 0.6000000 0.7714286 0.10000000 0.6142857 0.2714286 0.4857143 0.8714286
#>          [,43]     [,44]     [,45]     [,46]     [,47]     [,48]     [,49]
#> [1,] 0.9428571 1.0000000 0.4714286 0.7714286 0.4714286 0.7428571 0.5142857
#> [2,] 0.6857143 0.3000000 0.3142857 1.0000000 0.7000000 0.4857143 0.5428571
#> [3,] 0.8142857 0.2428571 0.3571429 0.5000000 0.7142857 0.4000000 0.2142857
#> [4,] 0.2000000 0.7571429 0.0000000 0.1571429 0.3857143 0.9142857 0.1285714
#> [5,] 0.9714286 0.7142857 0.9000000 0.5714286 0.9714286 0.9571429 0.8571429
#> [6,] 0.7571429 0.6714286 0.2428571 0.8571429 0.4857143 0.7428571 0.9142857
#>          [,50]
#> [1,] 0.9000000
#> [2,] 1.0000000
#> [3,] 0.8428571
#> [4,] 0.6714286
#> [5,] 0.9000000
#> [6,] 0.5285714
library(bayesplot)
pp_check(output_HMDCM)

pp_check(output_HMDCM, plotfun="dens_overlay", type="item_mean")

pp_check(output_HMDCM, plotfun="hist", type="item_OR")
#> `stat_bin()` using `bins = 30`. Pick better value with `binwidth`.

pp_check(output_HMDCM, plotfun="stat_2d", type="item_mean")

pp_check(output_HMDCM, plotfun="scatter_avg", type="total_score")

pp_check(output_HMDCM, plotfun="error_scatter_avg", type="total_score")